Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd3eapQ76KJ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cd3eapQ76KJ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms