Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpv1Q704Y3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpv1Q704Y3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trpv1Q704Y3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpv1Q704Y3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpv1Q704Y3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms