Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih3Q6ZWS4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cnih3Q6ZWS4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih3Q6ZWS4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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