Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RfflQ6ZQM0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RfflQ6ZQM0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms