Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup188Q6ZQH8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup188Q6ZQH8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nup188Q6ZQH8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nup188Q6ZQH8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms