Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
March6Q6ZQ89 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
March6Q6ZQ89 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
March6Q6ZQ89 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
March6Q6ZQ89 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms