Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn5Q6VZZ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn5Q6VZZ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms