Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tfap2eQ6VUP9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfap2eQ6VUP9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms