Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ift172Q6VH22 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ift172Q6VH22 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ift172Q6VH22 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ift172Q6VH22 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ift172Q6VH22 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ift172Q6VH22 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms