Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc154Q6RUT8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc154Q6RUT8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms