Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT7

Ccsmst1, Protein CCSMST1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsmst1Q6RUT7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccsmst1Q6RUT7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccsmst1Q6RUT7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccsmst1Q6RUT7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccsmst1Q6RUT7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccsmst1Q6RUT7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccsmst1Q6RUT7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccsmst1Q6RUT7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms