Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcaf3Q6QR59 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcaf3Q6QR59 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf3Q6QR59 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tcaf3Q6QR59 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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