Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bnip1Q6QD59 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bnip1Q6QD59 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bnip1Q6QD59 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms