Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b4Q6Q477 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b4Q6Q477 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp2b4Q6Q477 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms