Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnip4Q6PHZ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 456.4 ms