Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HjurpQ6PG16 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HjurpQ6PG16 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms