Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmeff1Q6PFE7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff1Q6PFE7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmeff1Q6PFE7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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