Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrm2bQ6PEE3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrm2bQ6PEE3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrm2bQ6PEE3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrm2bQ6PEE3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrm2bQ6PEE3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrm2bQ6PEE3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrm2bQ6PEE3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrm2bQ6PEE3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrm2bQ6PEE3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rrm2bQ6PEE3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rrm2bQ6PEE3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rrm2bQ6PEE3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rrm2bQ6PEE3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rrm2bQ6PEE3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rrm2bQ6PEE3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rrm2bQ6PEE3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rrm2bQ6PEE3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rrm2bQ6PEE3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms