Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dhx40Q6PE54 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx40Q6PE54 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dhx40Q6PE54 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dhx40Q6PE54 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dhx40Q6PE54 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dhx40Q6PE54 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dhx40Q6PE54 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dhx40Q6PE54 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms