Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcc2Q6PDG5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc2Q6PDG5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcc2Q6PDG5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms