Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trak1Q6PD31 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trak1Q6PD31 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trak1Q6PD31 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trak1Q6PD31 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trak1Q6PD31 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trak1Q6PD31 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trak1Q6PD31 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Trak1Q6PD31 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Trak1Q6PD31 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Trak1Q6PD31 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms