Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkab2Q6PAM0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prkab2Q6PAM0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkab2Q6PAM0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms