Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ3

Garem2, GRB2-associated and regulator of MAPK protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem2Q6PAJ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Garem2Q6PAJ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Garem2Q6PAJ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Garem2Q6PAJ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Garem2Q6PAJ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Garem2Q6PAJ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Garem2Q6PAJ3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Garem2Q6PAJ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Garem2Q6PAJ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Garem2Q6PAJ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Garem2Q6PAJ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Garem2Q6PAJ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Garem2Q6PAJ3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms