Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgb4Q6P8W9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmgb4Q6P8W9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms