Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc148Q6P5U8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc148Q6P5U8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc148Q6P5U8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms