Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1l1Q6NZP2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms