Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Soga3Q6NZL0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Soga3Q6NZL0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga3Q6NZL0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms