Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23ipQ6NZC7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms