Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ltv1Q6NSQ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ltv1Q6NSQ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ltv1Q6NSQ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms