Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sohlh1Q6IUP1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sohlh1Q6IUP1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh1Q6IUP1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms