Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt39Q6IFX4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt39Q6IFX4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt39Q6IFX4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms