Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt42Q6IFX2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt42Q6IFX2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt42Q6IFX2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt42Q6IFX2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms