Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nckap5lQ6GQX2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nckap5lQ6GQX2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms