Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6GQU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6GQU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6GQU0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6GQU0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6GQU0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6GQU0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q6GQU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6GQU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q6GQU0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q6GQU0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q6GQU0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms