Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmcc1Q69ZZ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms