Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrcc1Q69ZB0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrcc1Q69ZB0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrcc1Q69ZB0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms