Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp4Q68FH0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp4Q68FH0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp4Q68FH0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms