Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Git1Q68FF6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Git1Q68FF6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Git1Q68FF6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Git1Q68FF6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms