Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE9

Tshz2, Teashirt homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz2Q68FE9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tshz2Q68FE9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tshz2Q68FE9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tshz2Q68FE9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tshz2Q68FE9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms