Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CltcQ68FD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CltcQ68FD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CltcQ68FD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CltcQ68FD5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CltcQ68FD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms