Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4fQ66X05 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrp4fQ66X05 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms