Protein–RNA interactions for Protein: Q66L44

Cbarp, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbarpQ66L44 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CbarpQ66L44 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CbarpQ66L44 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CbarpQ66L44 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CbarpQ66L44 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CbarpQ66L44 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CbarpQ66L44 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CbarpQ66L44 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CbarpQ66L44 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CbarpQ66L44 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CbarpQ66L44 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms