Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ino80dQ66JY2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80dQ66JY2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms