Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprdQ64487 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprdQ64487 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprdQ64487 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprdQ64487 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms