Protein–RNA interactions for Protein: Q64332

Syn2, Synapsin-2, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn2Q64332 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syn2Q64332 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syn2Q64332 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syn2Q64332 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syn2Q64332 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syn2Q64332 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syn2Q64332 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syn2Q64332 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syn2Q64332 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Syn2Q64332 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syn2Q64332 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Syn2Q64332 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms