Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a5Q63ZW6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a5Q63ZW6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col4a5Q63ZW6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a5Q63ZW6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms