Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpd52Q62393 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52Q62393 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpd52Q62393 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpd52Q62393 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpd52Q62393 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpd52Q62393 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpd52Q62393 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpd52Q62393 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpd52Q62393 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms