Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sos1Q62245 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sos1Q62245 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sos1Q62245 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sos1Q62245 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sos1Q62245 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sos1Q62245 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sos1Q62245 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sos1Q62245 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sos1Q62245 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sos1Q62245 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sos1Q62245 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Sos1Q62245 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sos1Q62245 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms