Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpcQ62241 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SnrpcQ62241 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms