Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sycp1Q62209 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sycp1Q62209 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms